Выпущен UGENE 1.7.0 - интегрированный инструмент биолога

UGENE это свободное ПО для работы молекулярного биолога. Пакет является кроссплатформенным, локализован на русский язык. В новый релиз включена долгожданная функциональность по сборке контигов. Начиная с этого релиза UGENE может осуществлять выравнивание коротких последовательностей на реферируемый геном. На данный момент доступны два метода выравнивания:

* Модуль Genome aligner, основанный на уникальной разработке;
* Портирован популярный открытый алгоритм Bowtie.

Сделано множество изменений в консольной версии UGENE. Теперь стало возможно использовать консольную версию UGENE в сложных скриптах shell или как отдельную утилиту. В поставке UGENE доступны заранее подготовленные полезные сценарии: выравнивание, конвертация, поиск повторов и.т.д. Подробнее об этом в разделе документации.

Другие новые возможности:

* Новый продвинутый алгоритм анализа последовательностей, основанный на весовых матрицах;
* Улучшения Circular view: увеличение, поворот и другие;
* Поддержка новых опций поиска в NCBI BLAST в переработанном модуле удалённых запросов.
* Лого выравниваний;
* Переработан просмотрщик деревьев: новый визуальный интерфейс и режимы отображения.
* Поддержка записи формата GFF;
* Добавлен скрипт фреймворк;

Unipro UGENE распространяемым по лицензии GNU GPL. Установочные пакеты доступны для различных операционных систем.

Документация
Видео-уроки
Скачать UGENE 1.7.0

Ссылки для вставки

<a href="http://www.rusnix.ru/publ/816.html">Выпущен UGENE 1.7.0 - интегрированный инструмент биолога</a>

[url=http://www.rusnix.ru/publ/816.html]Выпущен UGENE 1.7.0 - интегрированный инструмент биолога[/url]

Информация о публикации

Рейтинг публикации: 76 / + / –Голос отдан

Теги к публикации: Теги не присвоены